農藝與種業是海南大學的傳統優勢學科專業,其包括作物、園藝和草業科學、種業學等四個研究方向。其中作物方向是以國家戰略物資橡膠,熱帶特色作物木薯、檳榔、甘蔗等為主要對象,開展作物高產與資源高效栽培理論與技術、作物高產優質協調機理與栽培調控機制、環境友好與作物安全生產理論與技術等的研究與應用;園藝方向主要以在香蕉、芒果等熱帶果樹資源的收集、評價、創新和利用,熱帶水果、蔬菜采后生理與保鮮,香蕉、蔬菜的抗逆機理,熱帶蘭花種質資源保護與應用等為發展方向,現已逐漸形成了自身的特色;草業方向已形成了以熱帶牧草與飼料作物栽培與育種、熱帶草坪草遺傳育種等為特色和優勢的學術發展方向;種業方向依托南繁育種、文昌航天育種,國家種子中轉站的建設,結合熱帶種質資源,從種子生物學,種子資源庫建設等方面入手,培育熱帶優良新品種,并進行推廣與應用的發展方向。